叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
医闾先生集序卷首医闾先生集卷一医闾先生集卷三医闾先生集卷四医闾先生集卷五医闾先生集卷六医闾先生集卷之 【 之：衍文】 七医闾先生集卷八医闾先生集卷九书医闾先生集后
论治法论伤各要害处不治论用药论各穴要害之处论验轻重伤诀论用药要诀论各伤主方
自叙凡例卷一总论察色听声脉法脉应杂病看虎口三关法小儿指形图（十五幅）（图缺）初生诸病胎惊胎痫胎风胎黄胎寒胎热撮口鹅口（一名噤口风．又名雪口．）脐风脐湿肿脐疮脐突惊风惊搐由脏腑惊搐痫痉不同伤风伤食发搐惊
序卷上流注指微针赋流注经络井荥说平人气象论经隧周环图手太阴肺经手阳明大肠经足阳明胃经足太阴脾经手少阴心经手太阳小肠经足太阳膀胱经足少阴肾经手厥阴心包经手少阳三焦经足少阳胆经足厥阴肝经卷中井荥俞经合部分
濒湖炮炙法
叙静功静功妙药醒语静功妙药八懿静功妙药前珍静功妙药九种闭息导引八段锦八段锦诗十六字三字六字十二字七返九还袁了凡静功诀纪验纪验二刻
简介细目序言上卷中卷下卷
序一序二序三重锓类证治裁序序四自序皇清例授文林郎先考羲桐府君传略凡例卷之首内景综要卷之一中风论治中风脉候附方中风脉案伤风论治伤风脉候附方伤风脉案伤寒治要经腑论伤寒脉案温症论治温症脉候附方温症脉案风温脉
嘱言上编总论歌痈疽总论痈疽总论歌痈疽总论歌解痈疽阳症歌痈疽阴症歌阴阳相半歌痈疽善恶歌痈疽五善歌痈疽七恶歌诸般坏症歌中编处方篇锅烈制法金丹制法石青制法银翠制法附∶灵药释性第一方·中九丸第二方·金蚣丸第三