《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
扁鹊神应鍼灸玉龙经
叙卷上伤寒论难读并宜补大旨三阳三阴分经名义伤寒重病多是下焦伏寒伏寒触发与伤寒时温脉证并病机异同即病伏气直中传经四证异同晚发是伤寒正病两感有三水气凌心即是三焦伤伤寒杂病皆有之无端暴喘即是寒入命门伤寒杂病
卷一风癞论受病所在经络三十六疯六经分属大麻风蛇皮风脱跟风鱼鳞风邪魅风血风鹅掌风鼓槌风血痹风糕风痛风癫风半肢风软瘫风紫云风干风干风干风白癜风蚝风历节风壁泥风疹风哑风冷麻风漏蹄风蛤蟆风核桃风水风热风雁来风
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分第6部分
嘱言上编总论歌痈疽总论痈疽总论歌痈疽总论歌解痈疽阳症歌痈疽阴症歌阴阳相半歌痈疽善恶歌痈疽五善歌痈疽七恶歌诸般坏症歌中编处方篇锅烈制法金丹制法石青制法银翠制法附∶灵药释性第一方·中九丸第二方·金蚣丸第三
序新刻药鉴卷之一寒热温平四赋，增补东垣未尽之意药性（寒门）药性（热门）药性（温门）药性（平门）新刻药鉴卷之一用药分根梢制药资水火用药丸散例解药毒法用药生熟法药性阴阳论病症标本论取方之法论各经补泻及专主
卷一九针原始歌九针式图并九针主治法歌行针次第手法歌行针分寸法歌十二经井荥俞经合原刺浅深歌五脏井荥俞经合歌六腑井荥俞原经合歌十二经表里原络总歌肺经表里原络穴主治歌大肠经表里原络穴主治歌脾经表里原络穴主治
序序医家源流卷之上评脉（一）察视（二）五脏（三）汗吐下温水火刺灸八法（四）五脏虚实(五)五脏绝死（六）脉（七）周身经穴（八）伤寒（九）六经（十）时行疫疠（十一）湿（十二）寒热往来（十三）恶寒（十四）背
序先议病后用药极闸人定议病式论金道宾真阳上脱之症金道宾后案辨袁仲卿小男死证再生奇验并详诲门人辨黄长人伤寒疑难危证治验并详诲门人治金鉴伤寒死证奇验辨徐国祯伤寒疑难急证治验治钱仲昭伤寒发危证奇验治伤寒坏证