序凡例九针式卷一难经一、补泻二、补泻相反三、针刺浅深四、先后浅深五、井荥俞经合主病六、四时井荥俞经合刺七、脏腑荥俞合皆以井为始八、脏腑井荥为五六九、阴阳井荥木金相生不同十、出井入合十一、欲刺井当刺荥十
医脉摘要
曹序自序序例卷之一·阴阳脏腑部阴阳五脏卷之二·阴阳脏腑部诊法通论诊虚实法、诊寒热法（俱入治法）诊病传变（诊病将死期入诊生死条）诊病愈剧诊生死诸脉诊病杂法诊一岁病证相同卷之三·阴阳脏腑部治法通论倒仓法药
血證論卷一 陰陽水火氣血論卷二 吐血卷三 汗血卷四 便血卷五 瘀血卷六 癆瘵卷七卷八 方劑
保养生胎论妇人劳伤偏郁忧思食积论男女尺脉盛弱妇人受胎妇人经水不调血虚白带崩漏安胎
劝读十则
素灵微蕴序素灵微蕴卷一胎化解脏象解经脉解营卫解脏候解素灵微蕴卷二五色解五声解问法解诊法解医方解素灵微蕴卷三齁喘解吐血解惊悸解悲恐解飧泄解肠澼解脾胃解火逆解素灵微蕴卷四消渴解气鼓解噎膈解反胃解中风解带下
医学发明
自序卷一一明望色之法望色论（附律一条）一明闻声之法闻声论（附律二条）一明辨息之法辨息论（附律一条）一明胸中大气之法大气论（附律一条）一明问病之法问病论（附律一条）一明切脉之法切脉论（附律一条）一明合色
序自叙卷一朝廷对于医者之医方卷二世界对于医者之医方卷三医者自医之医方